Kyon, votre lycéen typique, a depuis longtemps abandonné sa croyance dans le surnaturel. Cependant, en rencontrant Haruhi Suzumiya, il découvre rapidement que c’est le surnaturel qui l’intéresse, entre autres choses. Quand Haruhi se lamente sur le manque de clubs intrigants autour de l’école, Kyon inspire Haruhi à former son propre club. En conséquence, la Brigade SOS est formée, un club qui se spécialise dans tout ce qui est surnaturel.
A son grand chagrin, Kyon, ainsi que le rat de bibliothèque silencieux, Yuki Nagato, le timide et timide Mikuru Asahina, et Itsuki Koizumi, toujours souriant, sont recrutés comme membres. L’histoire suit les folles aventures que ces quatre personnes endurent sous la houlette de leur chef fantaisiste, Haruhi. L’histoire est basée sur les light novels de Nagaru Tanigawa.

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