Etre entouré de jolies filles portant de jolis vêtements, c’est tout ce que Eruna Ichinomiya désire. Depuis Mikagura High School se trouve à avoir les uniformes les plus mignons autour, elle décide de s’inscrire dans cette prestigieuse école secondaire connue pour ses clubs culturels.
Cependant, elle ne se rend pas compte que l’adhésion à un club est obligatoire et que les représentants de chaque club doivent se battre pour obtenir un classement. Sur la base de ces classements, les membres du club reçoivent un logement et de la nourriture. A la poursuite de Seisa Mikagura, la plus belle fille de l’école, Eruna rejoint le club d’accueil mais se retrouve poussée à se battre lors de la prochaine bataille de club. Avec les autres représentants de club ayant des pouvoirs uniques, la compétition sera certainement féroce !
Basé sur la série de chansons populaires, Mikagura Gakuen Kumikyoku suit Eruna alors qu’elle explore les différents clubs de l’école et aide les membres avec leurs vies troublées, qui se disputent aussi la première place à l’école.

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